fix: improve doc link navigation and tree display

- Fix link resolution with proper relative/absolute path handling
- Improve link styling with underline decoration
- Hide leaf nodes from tree, only show directories
- Fix log file path for packaged app

docs/api/core/smartptr/Ref.md

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+# SmartPtr::Ref
+
+```cpp
+template<typename T>
+using Ref = std::shared_ptr<T>;
+```
+
+共享引用智能指针类型别名。
+
+**描述**
+
+`Ref<T>` 是 `std::shared_ptr<T>` 的类型别名，提供共享所有权的智能指针。多个 `Ref` 可以指向同一个对象，通过引用计数管理生命周期。当最后一个 `Ref` 被销毁时，对象会被自动删除。
+
+**模板参数：**
+- `T` - 被托管对象的类型
+
+**复杂度：** O(1)
+
+**示例：**
+
+```cpp
+#include <XCEngine/Core/SmartPtr.h>
+
+class MyClass {
+public:
+    void DoSomething() { /* ... */ }
+};
+
+Core::Ref<MyClass> ref1 = Core::MakeRef<MyClass>();
+Core::Ref<MyClass> ref2 = ref1;  // 共享所有权
+
+if (ref1) {
+    ref1->DoSomething();
+}
+```
+
+## 相关文档
+
+- [SmartPtr 总览](smartptr.md) - 返回类总览
+- [MakeRef](MakeRef.md) - 创建 Ref 的工厂函数