docs: 重构 API 文档结构并修正源码准确性

- 重组文档目录结构: 每个模块的概述页移动到模块子目录
- 重命名 index.md 为 main.md
- 修正所有模块文档中的错误:
  - math: FromEuler→FromEulerAngles, TransformDirection 包含缩放, Box 是 OBB, Color::ToRGBA 格式
  - containers: 新增 operator==/!= 文档, 补充 std::hash DJB 算法细节
  - core: 修复 types 链接错误
  - debug: LogLevelToString 返回大写, timestamp 是秒, Profiler 空实现标注, Windows API vs ANSI
  - memory: 修复头文件路径, malloc vs operator new, 新增方法文档
  - resources: 修复 Shader/Texture 链接错误
  - threading: TaskSystem::Wait 空实现标注, ReadWriteLock 重入描述, LambdaTask 链接
- 验证: fix_links.py 确认 0 个断裂引用

docs/api/debug/logger/shutdown.md

@@ -0,0 +1,26 @@
+# Logger::Shutdown
+
+```cpp
+void Shutdown()
+```
+
+关闭日志系统。移除所有注册的 Sink，刷新缓冲区并重置内部状态。在程序退出前调用，确保所有日志数据已写入输出目标。
+
+**复杂度：** O(n)，n 为注册的 Sink 数量
+
+**示例：**
+
+```cpp
+#include <XCEngine/Debug/Logger.h>
+
+int main() {
+    XCEngine::Debug::Logger::Get().Initialize();
+    // ... 应用逻辑 ...
+    XCEngine::Debug::Logger::Get().Shutdown();
+    return 0;
+}
+```
+
+## 相关文档
+
+- [Logger 总览](logger.md) - 返回类总览