docs: 重构 API 文档结构并修正源码准确性

- 重组文档目录结构: 每个模块的概述页移动到模块子目录
- 重命名 index.md 为 main.md
- 修正所有模块文档中的错误:
  - math: FromEuler→FromEulerAngles, TransformDirection 包含缩放, Box 是 OBB, Color::ToRGBA 格式
  - containers: 新增 operator==/!= 文档, 补充 std::hash DJB 算法细节
  - core: 修复 types 链接错误
  - debug: LogLevelToString 返回大写, timestamp 是秒, Profiler 空实现标注, Windows API vs ANSI
  - memory: 修复头文件路径, malloc vs operator new, 新增方法文档
  - resources: 修复 Shader/Texture 链接错误
  - threading: TaskSystem::Wait 空实现标注, ReadWriteLock 重入描述, LambdaTask 链接
- 验证: fix_links.py 确认 0 个断裂引用

docs/api/core/smartptr/Ref.md

@@ -0,0 +1,40 @@
+# SmartPtr::Ref
+
+```cpp
+template<typename T>
+using Ref = std::shared_ptr<T>;
+```
+
+共享引用智能指针类型别名。
+
+**描述**
+
+`Ref<T>` 是 `std::shared_ptr<T>` 的类型别名，提供共享所有权的智能指针。多个 `Ref` 可以指向同一个对象，通过引用计数管理生命周期。当最后一个 `Ref` 被销毁时，对象会被自动删除。
+
+**模板参数：**
+- `T` - 被托管对象的类型
+
+**复杂度：** O(1)
+
+**示例：**
+
+```cpp
+#include <XCEngine/Core/SmartPtr.h>
+
+class MyClass {
+public:
+    void DoSomething() { /* ... */ }
+};
+
+Core::Ref<MyClass> ref1 = Core::MakeRef<MyClass>();
+Core::Ref<MyClass> ref2 = ref1;  // 共享所有权
+
+if (ref1) {
+    ref1->DoSomething();
+}
+```
+
+## 相关文档
+
+- [SmartPtr 总览](smartptr.md) - 返回类总览
+- [MakeRef](MakeRef.md) - 创建 Ref 的工厂函数