docs: 重构 API 文档结构并修正源码准确性

- 重组文档目录结构: 每个模块的概述页移动到模块子目录
- 重命名 index.md 为 main.md
- 修正所有模块文档中的错误:
  - math: FromEuler→FromEulerAngles, TransformDirection 包含缩放, Box 是 OBB, Color::ToRGBA 格式
  - containers: 新增 operator==/!= 文档, 补充 std::hash DJB 算法细节
  - core: 修复 types 链接错误
  - debug: LogLevelToString 返回大写, timestamp 是秒, Profiler 空实现标注, Windows API vs ANSI
  - memory: 修复头文件路径, malloc vs operator new, 新增方法文档
  - resources: 修复 Shader/Texture 链接错误
  - threading: TaskSystem::Wait 空实现标注, ReadWriteLock 重入描述, LambdaTask 链接
- 验证: fix_links.py 确认 0 个断裂引用

docs/api/core/filewriter/Flush.md

@@ -0,0 +1,42 @@
+# FileWriter::Flush
+
+```cpp
+bool Flush();
+```
+
+刷新缓冲区。
+
+**描述**
+
+将缓冲区中的数据强制写入磁盘，确保数据持久化。在写入大量数据后应调用此方法以确保数据已保存。
+
+**返回：** `bool` - 是否刷新成功
+
+**复杂度：** O(1)
+
+**示例：**
+
+```cpp
+#include <XCEngine/Core/FileWriter.h>
+
+FileWriter writer("output.txt");
+if (writer.IsOpen()) {
+    // 写入大量数据
+    for (int i = 0; i < 1000; i++) {
+        writer.Write("Line ");
+        writer.Write(std::to_string(i).c_str());
+        writer.Write("\n");
+    }
+    
+    // 刷新确保数据写入磁盘
+    writer.Flush();
+    
+    // 数据已安全保存
+    writer.Close();
+}
+```
+
+## 相关文档
+
+- [FileWriter 总览](filewriter.md) - 返回类总览
+- [Write](Write.md) - 写入数据